В борьбе с вредными насекомыми и клещами применяют различные биологические методы. Традиционным стало использование хищников и паразитов. Изучаются естественные враги вредителей из мира насекомых и клещей, возможность их акклиматизации, массового размножения и использования. Например, разведение на биофабриках и выпуск на поля трихограммы - паразита отдельных видов вредных бабочек - стали обычными.
Применение хищников и паразитов в борьбе с вредителями хлебных запасов имеет ограниченное значение, хотя в природе известны многочисленные их враги. Это связано с особенностями зерна и продуктов его переработки. Введение в них хищников и паразитов практически малоэффективно, так как засоряет продукт и может ухудшить его качество.
Широко распространенным биологическим методом является применение возбудителей грибковых, бактериальных и вирусных болезней насекомых и клещей. Ведется поиск наиболее агрессивных рас микроорганизмов, оптимальных вариантов сочетания их с пестицидами.
В отношении вредителей хлебных запасов изучаются различные штаммы Bacillus thuringiensis. Исследованиями была показана высокая эффективность двух штаммов: против амбарного долгоносика и зернового точильщика, но эти штаммы не вызывали гибели жуков малого мучного хрущака. Отмечена чувствительность зерновой моли к этому микробу.
Имеющиеся данные экспериментальных исследований убеждают в перспективности микробиологического метода борьбы с вредителями хлебных запасов.
Среди биологических методов распространено использование ювенильных гормонов (регуляторов роста) насекомых. Ювенильный гормон, вырабатываемый железами насекомых, регулирует рост и превращение насекомого из личинки в куколку. На некоторых стадиях развития наличие ювенильного гормона является необходимым, на других присутствие его приводит к гибели организма.
Высокой эффективностью в угнетении популяций рисового и амбарного долгоносика, малого мучного хрущака, зернового точильщика, суринамского мукоеда, южной и сухофруктовой огневки и зерновой моли отличаются ингибиторы синтеза хитина.
Еще одним биологическим методом является выпуск в природную популяцию стерильных самцов насекомых. Половую стерилизацию их проводят с помощью ионизирующих излучений или химическими стерилянтами. Стерильные самцы отыскивают природных самок и спариваются с ними. В результате самки откладывают нежизнеспособные яйца: происходит вырождение популяций. Такой метод может быть перспективным, например, в борьбе с бабочками на зерноперерабатывающих предприятиях.