Семена в семенохранилищах хранят насыпью, в обычных закромах и в мешках, уложенных штабелями. Практикуется также их хранение в специальных закромах, контейнерах или вертикальных башнях различных конструкций, оборудованных установками активного вентилирования.

Семена суперэлиты, элиты многолетних и однолетних трав, а также зернобобовых кормовых культур обязательно хранят в мешках.

В мешках хранят также семена массовых репродукций особо дефицитных культур, а также семена, обладающие повышенной текучестью (крестоцветных кормовых культур - турнепса, брюквы, репы, капусты, а также клевера розового и белого, полевицы и других культур).

Размещают семена по сортам, а в пределах сорта - по репродукциям, категориям сортовой чистоты, классам посевного стандарта, а также по влажности, зараженности вредителями и болезнями, засоренности и другим показателям посевных качеств.

Для того чтобы избежать засорения одних семян другими при открытом их хранении, закрома не засыпают до самого верха на 15-20 см. Семена многолетних трав и других кормовых культур, которые при очистке трудноотделимы, в соседние закрома не засыпают. Например, клевер красный нельзя помещать рядом с розовым, овсяницу луговую - с райграсом пастбищным, сорго - с сорго-суданковыми гибридами, люцерну - с клевером красным и т. д. Их разделяют закромом с культурой, семена которой легкоотделимы при очистке.

При укладке мешков в штабель на асфальтированных, бетонных, каменных и глинобитных полах возможно отпотевание, поэтому под мешки кладут сплошные деревянные стеллажи, отстоящие от пола не менее чем на 10 см.

Укладывают мешки в штабель «тройником» или «двойником». При укладке «тройником» два мешка кладут впритык друг к другу боками и поперек них - третий, «двойником» - два мешка первого ряда помещают параллельно на ребро на небольшом расстоянии друг от друга, а следующую пару мешков - поперек них. Расстояние между штабелями и стенами и ширина проходов между штабелями 0,5-1 м. Длина штабеля может быть различной в зависимости от размеров складской площади и партии семян. Ширина штабеля должна быть не более двух мешков, уложенных в длину, высота укладки для многолетних трав в холодное время - в пять мешков, в теплое - четыре, для гороха кормового и кормовых бобов - соответственно в восемь и шесть мешков. Высоту слоя насыпи семян устанавливают в зависимости от вида культуры, влажности и состояния семян, времени года; она колеблется от 1 до 2,5 м. Свежеубранные семена в первые один-два месяца хранят наполовину меньшим слоем.

Семена с влажностью выше кондиционной насыпают слоем не более 0,2 м. Их проветривают или периодически перелопачивают, пока они не подсохнут. В закрома или башни, оборудованные установками активного вентилирования, влажные семена многолетних трав засыпают слоем не выше 2 м, по мере их высушивания насыпь увеличивают.

Семена хранят партиями. Партией называется определенное количество однородных семян (одной культуры, сорта, репродукции, года урожая, происхождения). Все семена, предназначенные для посева, передают по акту на хранение кладовщику или заведующему складом и регистрируют в книге учета.

В каждый мешок с семенами вкладывают бумажную этикетку, а снаружи в верхней его части пришивают тканевую этикетку с указанием хозяйства, вырастившего семена, названия культуры, сорта, репродукции семян, массы (нетто), номера партии, даты закладки на хранение, посевных качеств и цели хранения. В обычный мешок затаривают не более 50 кг семян, полиэтиленовые - не более 30-35 кг.

Каждую партию семян укладывают в хранилище отдельными штабелями.

Уложенные в штабеля мешки перекладывают один раз в четыре месяца, при этом верхние помещают в нижний ряд, а нижние - в верхний.

Для хранения используют двойные льноджутовые мешки. Внутренний мешок должен быть обязательно новым. В мешках не допускаются дыры, пробоины, прорывы, близны и недосеки, стежки и овал шва, пропуск стежка шва. При заполнении в мешках оставляют достаточное пространство для перетряхивания семян при перекладке.

Семена гороха, зараженные брухусом, складывают в отдельном помещении и немедленно дезинфицируют. Партии семян, пораженных головней, спорыньей, а также не удовлетворяющих требованиям стандарта по содержанию семян карантинных сорняков, можно размещать в одном хранилище со здоровыми семенами, но обязательно в отдельных закромах или штабелях.

Семена одного сорта, однородные по чистоте и другим признакам, но разные по влажности, также засыпают в отдельные закрома. Для экономии складских емкостей допускается смешивание семян, влажность которых отличается на небольшую величину.

Например, все партии семян сорго одного сорта и одинаковой сортовой и физической чистоты с влажностью 14% и меньше можно засыпать вместе. Вместе хранят также семена с влажностью 14-15%. Нельзя смешивать партии семян с влажностью, например, 14 и 17%.

Если при очередной проверке ранней весной устанавливают заметное снижение всхожести семян (на 5-8%), их высевают весной того же года. При обнаружении этого в позднеосеннее время семена просушивают при температуре 30-35°, чтобы не допустить дальнейшего снижения их всхожести до высева весной следующего года.

Для охлаждения воздуха в хранилище летом рекомендуется использовать передвижную холодильную машину, которая позволяет охлаждать воздух в хранилище до +7-10°.

Относительная влажность воздуха в хранилище не должна быть выше 60%. Ответственным периодом в этом отношении является ранневесеннее время. При быстром повышении температуры наружного воздуха он может проникнуть в хранилище и вызвать отпотевание и повышение влажности семян. Чем больше они охладились за зиму и чем быстрее наступило потепление и таяние снега, тем сильнее они могут пострадать. В таких случаях стремятся задержать проникновение наружного воздуха в хранилище - избегают открытия дверей, закрывают на это время вентиляционные отверстия и т. д. Осенью условия хранения могут ухудшиться в период длительного ненастья, когда относительная влажность наружного воздуха достигает 95-100% (особенно в утренние и вечерние часы). Уберечь обычные хранилища от повышения влажности в такие периоды можно, как и весной, защищая их от быстрого вторжения сырого воздуха.